RepeatMasker 基因组重复区域文件

rmsk.txt

一般关注标红的几列,


各列含义:

Schema for RepeatMasker - Repeating Elements by RepeatMasker 

"rmsk.txt" 是 UCSC Genome Browser 提供的一个文件,用于描述重复序列的注释信息。通常,它包含了以下列:

1. **bin**:UCSC Genome Browser 使用的染色体块索引,用于快速查找和排序。

2. **swScore**:Smith-Waterman算法计算得到的比对得分。

3. **milliDiv**:经过比对的序列中的碱基差异率,以千分之一为单位。

4. **milliDel**&#

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